Ilmuwan Teliti Kemungkinan Virus Corona Hidup di Tubuh Anjing, Ini Hasilnya

Evolusi Virus Corona Covid-19

Jurnal Molecular Biology and Evolution yang diterbitkan pada 14 April menawarkan analisis terbaru yaitu, virus corona bisa hinggap dahulu pada hewan anjing.

Xia mendapat kesimpulan tersebut, dari proses pemindahan genetik virus corona Covid-19 dan virus corona lainnya untuk fitur yang spesifik dikenal dikenal sebagai situs CpG, urutan kode genetik di mana senyawa sitosin (C) diikuti oleh senyawa guanine (G).

Menurut UniProt, database protein online, sistem kekebalan manusia melihat situs CpG sebagai bendera merah, menandakan bahwa ada virus invasif. Sebuah protein manusia yang disebut Zinc Finger Antiviral Protein (ZAP) menempel pada situs CpG pada kode genetik virus dan merekrut bantuan untuk memecah pathogen. Teorinya mengikuti bahwa, semakin sedikit situs CpG, virus akan semakin rentan terhadap ZAP.

Xia menemukan bahwa virus corona Covid-19 membawa lebih sedikit situs CpG daripada virus corona lainnya yang diketahui pertama kali berevolusi pada hewan, termasuk SARS-CoV dan MERS-CoV. Selain itu, kerabat terdekat yang diketahui dari Covid-19, kelopak koronavirus RaTG13, mengandung lebih sedikit situs CpG dibandingkan kelelawar koronavirus terkait.

Penelitian ini Xia bisa mengambil kesimpulan, bahwa virus corona Covid-19 mungkin telah berevolusi di hospes baru dengan ekspresi ZAP tinggi, yang akan menempatkan tekanan evolusioner pada virus untuk melepaskan situs CpG.

Pada dasarnya, untuk bertahan hidup dan bereproduksi, patogen seperti virus corona Covid-19 harus dapat menghindari pejuang kekebalan inang, dan dalam hal ini berarti menyingkirkan situs CpG yang dapat mengingatkan protein ZAP terhadap virus.

Evolusi Virus COVID-19 Berkembang di Usus Anjing

Menurut Xia, hanya ada sedikit data tentang berapa banyak ZAP yang muncul di jaringan hewan. Ia mencoba mencari hewan lain dengan kadar CpG yang rendah. Kemudian ia menemukan virus corona yang menginfeksi usus anjing.

Dengan demikian menyimpulkan bahwa usus anjing mungkin mengandung tingkat ZAP yang memadai untuk mendorong evolusi virus dengan cara ini.

Xia dalam jurnal tersebut menjelaskan jika prekursor virus corona Covid-19 menginfeksi usus anjing, maka akan mengakibatkan evolusi cepat virus kehilangan situs CpG dan menjadi lebih siap untuk menginfeksi manusia. Di luar tingkat CpG yang rendah, penelitian ini tidak mencatat kesamaan genetik lainnya antara virus corona Ccovid-19 dan anjing yang terinfeksi.

Namun  Xia menyarankan bahwa usus anjing mungkin menyediakan lingkungan yang tepat bagi virus tersebut untuk berkembang.

Xia menyebut pada beberapa penelitian menunjukkan bahwa ZAP mRNA, yang berisi instruksi untuk membangun protein, muncul di paru-paru anjing dan usus besar tetapi konsentrasi yang lebih tinggi menumpuk di paru-paru. Mungkin bahwa kelebihan ZAP di paru-paru menjaga organ dari virus corona. Sedangkan konsentrasi ZAP yang lebih rendah di usus besar menyebabkan usus lebih gampang terhadap infeksi.

Apakah hipotesis Xia masuk akal?

Bukti Penelitian Dibantah Seorang Profesor

Pleuni Pennings, asisten profesor ekologi dan evolusi di San Francisco State University mengatakan hipotesis tersebut tidak mendukung kesimpulan dalam penelitian Xia. Pennings bersama timnya telah meneliti tingkat banyak virus CpG, dan menunjukkan banyak kelemahan dalam logika penelitianXia.

Penelitian tahun 2018 dalam jurnal PLOS Genetics, Pennings mensurvei tingkat CpG dalam virus HIV dan menyelidiki bagaimana patogen berevolusi dalam diri manusia. Dia kemudian memimpin penelitian serupa dari beberapa virus lain - termasuk virus demam berdarah, influenza, dan hepatitis B dan C - untuk mempelajari seberapa sering kehilangan atau mendapatkan situs CpG melalui mutasi.

Hasilnya, secara umum mutasi yang menambahkan situs CpG cenderung ditemukan dalam sampel virus yang diambil dari orang lebih jarang daripada mutasi yang menghapus situs CpG dari genom. Menurut Pennings, Xia memang menemukan bahwa virus corona Covid-19 mengandung lebih sedikit situs CpG daripada virus corona lain, Dengan asumsi itu, maka itu justru menimbulkan pertanyaan mengapa hal itu bisa terjadi.

Pennings menjelaskan jika ada alasan evolusi untuk menjelaskan mengapa Covid-19 kehilangan situs CpG, alasan evolusi itu mungkin tidak memberikan keuntungan bagi virus untuk menginfeksi manusia. Xia mencatat penelitian menunjukkan hubungan antara penurunan CpG dalam genom viral load dan peningkatan virulensi. Artinya virus CpG rendah muncul terkait dengan infeksi yang lebih parah.

Pennings membantah, meskipun evolusi mendukung mutasi yang menghapus situs CpG, dan ada kecenderungan umum mengikat lebih sedikit situs CpG untuk infeksi yang lebih parah, hal itu itu tidak berarti bahwa virus dengan jumlah situs CpG yang rendah tentu lebih ganas.